学校校本部设有基础医学院、公共卫生与家庭医学学院、化学生物学与药学院、生物医学工程学院、中医药学院、卫生管理与教育学院、护理学院、燕京医学院、继续教育学院及国际学院;学校拥有14所临床医学院(其中13所临床医学院是附属医院)，包括宣武医院(第一临床医学院)、附属北京友谊医院(第二临床医学院)、附属北京朝阳医院(第三临床医学院)、附属北京同仁医院(第四临床医学院)、附属北京天坛医院(第五临床医学院)、附属北京安贞医院(第六临床医学院)、附属复兴医院(第八临床医学院)、附属北京佑安医院(第九临床医学院)、附属北京儿童医院(儿科医学院)、附属北京口腔医院(口腔医学院)、附属北京安定医院(精神卫生学院)、附属北京妇产医院(妇产医学院)、附属北京中医医院(中医药临床医学院)和康复医学院(中国康复研究中心)，以及预防医学教学基地(北京市疾病预防控制中心)。学校还设有首都医科大学北京神经外科学院、首都医科大学北京眼科学院、首都医科大学北京耳鼻咽喉科学院3个专科学院以及25个专科学系。

　　学校和附属医院现有教职员工和医务人员20346人(校本部1577人，附属医院18769人)。有院士6人，特聘院士5人，正高职称1098人，副高职称2118人。其中教授379人(校本部75人，附属医院304人),副教授625人(校本部 164人,附属医院461人)。现有全日制在校生8373人，其中研究生2318人，本科生4011人，高职高专生2010人，留学生34人;成教学生 7813人。学校学科专业齐全,学科力量雄厚,在基础和临床各专业拥有一大批具有很高造诣的专家学者。现有8个国家重点学科，2个国家重点(培育)学科，2个北京市一级重点学科，8个北京市二级重点学科，2个北京市一级重点建设学科，12个北京市二级重点建设学科，1个教育部省部重点实验室，1个教育部省部共建重点实验室，4个北京市重点实验室;有41个博士学位授权点，78个硕士学位授权点和2个博士后科研流动站。除了法医学外，实现了生物医药学科硕士学位点一级学科的全覆盖。

　　校本部和附属医院总占地面积104.9万平方米(其中校本部26.1万平方米,附属医院78.8万平方米);总建筑面积159.9万平方米(校本部 25.4万平方米，附属医院134.5万平方米);固定资产总值近88.4亿元(校本部近7.1亿元，附属医院近81.3亿元);教学科研仪器设备总值 11.5多亿元(校本部2.4亿元，附属医院9.1亿元);图书馆藏书100.6万册(校本部61.6万册，附属医院39万册);住院病床11611张。学校开办的七年制专业中设有临床医学和口腔医学;本科专业中设有临床医学、基础医学、口腔医学、预防医学、药学、中医学、中药学、护理学、生物医学工程、假肢矫形工程、康复治疗学、卫生事业管理、医学实验学和卫生法学14个专业。高职高专教育设有护理、医学检验技术、药学等14个专业。学校以培养高层次本科生与研究生为核心、以临床应用型人才为主，兼顾培养预防、康复、生物医学工程和医学基础各学科各层次人才，形成了全方位、多层次、创新型人才培养模式。

　　学校具有较强的学术发展与科研实力，在校本部和附属医院拥有一批国家级和市级重点学科和重点实验室;建有高水平的国家级或市级研究和培训机构，如国家生命科学与技术人才培养基地、卫生部全科医学培训中心、北京市全科医学培训中心、新医药北京市技术转移中心、首都卫生管理与政策研究基地、临床医学研究所、基础医学研究所、神经科学研究所、眼科研究所、老年病医疗研究中心、泌尿外科研究所、心肺血管医疗研究中心、疼痛医学研究所、卫生毒理检测中心、生物工程技术研究中心、中医肝病临床研究中心、临床病理中心、生殖医学研究所和心血管疾病临床试验及社区干预中心等。近5年来，学校承担了国家“973”、 “863”、国家自然科学基金、国家社会科学基金、北京市自然基金，以及教育部、卫生部、北京市科委、北京市教委等科研项目1030项，其中国家级科研项目328项，累计科研经费402487.71万元;获得各类各级奖励107项，其中国家科技进步二等奖7项、北京市科学技术进步一等奖3项、高等学校科学技术一等奖1项、中华医学科技奖一等奖2项、何梁何利基金科学与技术进步奖2项，首届吴阶平医学奖1项;获得授权发明专利32项。神经生物学、细胞生物学、基础免疫学、医学图像处理、生物信息检测与处理、神经内科、神经外科、心脏内外科、肾移植、呼吸内科、消化内科、口腔颌面外科、眼科、耳鼻咽喉科、小儿血液病等领域在国内外享有较高的声誉。

　　学校有良好的教学科研辅助设施，其中有图书馆、信息与通讯中心、现代教育技术中心、实验动物科学部、医学实验与测试中心、学报编辑部(期刊社)、医学教育研究所等。

　　学校十分重视对外交流与合作，先后与30多个国家和地区签定了友好交流与合作协议，其中包括美国西北大学、德州大学休斯顿医学院、纽约州立大学布法罗分校、费城天普大学、南佛罗里达大学、澳大利亚莫纳什大学、拉筹伯大学、迪肯大学、福林德斯大学、奥地利欧亚太平洋学术网络、瑞典卡罗琳斯卡大学、挪威奥斯陆大学、意大利费拉拉大学、威尼斯国际大学、英国卡迪夫大学、日本川崎医科大学、香港中文大学等。近十年来，先后接待美国、加拿大、英国、澳大利亚、法国、瑞典、日本、荷兰、意大利、德国、丹麦及台湾、香港和澳门等50多个国家和地区的专家学者8000余人次来校进行学术交流和参观访问;吸引了来自10 余个国家百余名留学生在校进行学历教育，涵盖了本科、硕士、博士研究生。同时，学校积极选送教师、科研人员和管理干部出国进修，参加学术会议和考察访问。

　　全体首医人求真务实、齐心协力、自主创新、和谐发展，正在努力将首都医科大学建设成为立足首都、面向全国、走向世界，国内一流、国际知名的医科大学。